Kapsule i slojevi sluzi
Mnoge bakterijske stanice izlučuju neki izvanćelijski materijal u obliku kapsule ili sluznog sloja. Slojni sloj je slabo povezan s bakterijom i može se lako isprati, dok je kapsula čvrsto vezana uz bakteriju i ima određene granice. Kapsule se mogu vidjeti pod svjetlosnim mikroskopom, ako stanice stave u suspenziju tinte iz Indije. Kapsule isključuju tintu i izgledaju kao bistri halosi koji okružuju bakterijske stanice. Kapsule su obično polimeri jednostavnih šećera (polisaharidi), iako je kapsula Bacillus anthracis napravljena od poliglutaminske kiseline. Većina kapsula je hidrofilnih („vodenih“) i mogu pomoći bakteriji da izbjegne isušivanje (dehidraciju) sprečavanjem gubitka vode. Kapsule mogu zaštititi bakterijsku stanicu od gutanja i uništavanja bijelih krvnih stanica (fagocitoza). Iako je točan mehanizam za bijeg iz fagocitoze nejasan, može se dogoditi jer kapsule čine dijelove površinskih bakterija klizavijima, pomažući bakteriji da izbjegne zahvatanje fagocitnih stanica. Prisutnost kapsule kod Streptococcus pneumoniae najvažniji je čimbenik njezine sposobnosti da izazove upalu pluća. Mutantne sojeve bakterije S. pneumoniae koji su izgubili sposobnost stvaranja kapsula lako se uzimaju bijela krvna zrnca i ne izazivaju bolest. Povezanost virulencije i stvaranja kapsula nalazi se i u mnogim drugim vrstama bakterija.
Kapsularni sloj izvanstaničnog polisaharidnog materijala može zatvoriti mnoge bakterije u biofilm i služi mnogim funkcijama. Streptococcus mutans, koji uzrokuje zubni karijes, razgrađuje saharozu u hrani i koristi jedan od šećera za izgradnju svoje kapsule koja se čvrsto zalijepi za zub. Bakterije koje su zarobljene u kapsuli koriste drugi šećer za poticanje metabolizma i stvaranje jake kiseline (mliječne kiseline) koja napada zubnu caklinu. Kada Pseudomonas aeruginosa kolonizira pluća osoba s cističnom fibrozom, stvara debeli kapsularni polimer alginske kiseline koji doprinosi poteškoćama u iskorjenjivanju bakterija. Bakterije roda Zoogloea izlučuju vlakna celuloze koja bakterije uklapaju u jato koje lebdi na površini tekućine i drži bakterije izložene zraku, što je uvjet za metabolizam ovog roda. Nekoliko bakterija u obliku šipke, kao što je Sphaerotilus, izdvajaju duge kemijski složene cjevaste ovojnice koje obuhvaćaju znatan broj bakterija. Korice ovih i mnogih drugih okolišnih bakterija mogu se ograditi željeznim ili manganovim oksidima.
Flagella, fimbriae i pili
Mnoge su bakterije pokretne, sposobne su plivati kroz tekući medij ili kliziti ili se prelijevati preko čvrste površine. Plivajuće i plivajuće bakterije posjeduju flagele, koji su izvanstanični dodaci potrebni za pokretljivost. Flagele su duge, spiralne niti napravljene od jedne vrste proteina i smještene su ili na krajevima stanica šipkastog oblika, kao u Vibrio cholerae ili Pseudomonas aeruginosa, ili po cijeloj staničnoj površini, kao u Escherichia coli. Flagele se mogu naći i na gram-pozitivnim i gram-negativnim šipkama, ali su rijetke na kokima i zarobljene su u aksijalnim nitima u spirohetama. Žučnjak je pričvršćen na svojoj bazi na bazalno tijelo u staničnoj membrani. Protomobilna sila koja se stvara na membrani koristi se za okretanje flagelarnog filamenta, na način na koju turbina pokreće protok vodikovih iona kroz bazalno tijelo u ćeliju. Kad se flagele okreću u smjeru suprotnom od kazaljke na satu, bakterijska stanica pliva u ravnoj liniji; rotacija u smjeru kazaljke na satu rezultira plivanjem u suprotnom smjeru ili, ako ima više flagelluma po ćeliji, nasumičnim prevrtanjem. Kemotaksis omogućava bakteriji da prilagodi svoje ponašanje plivanja tako da može osjetiti i migrirati prema povećanju razine atraktivne kemikalije ili daleko od repelentnog.
Ne samo da bakterije mogu plivati ili klizati prema povoljnijim sredinama, već imaju i privitke koji im omogućuju prianjanje na površine i sprječavaju ispiranje tekućinama. Neke bakterije, poput E. coli i Neisseria gonorrhoeae, stvaraju ravne, krute izbočine u obliku šiljaka koje se nazivaju fimbrije (latinski za "niti" ili "vlakna") ili pili (latinski za "dlačice"), koji se šire sa površine bakterije i vežu se za specifične šećere u ostalim stanicama - za ove sojeve, epitelne stanice crijeva ili mokraćovoda, tj. Fimbrije su prisutne samo u gram-negativnim bakterijama. Određeni pili (koji se nazivaju sex pili) koriste se kako bi se omogućilo jednoj bakteriji da prepozna i prianja uz drugu u procesu seksualnog parenja koji se naziva konjugacija (vidi dolje reprodukcija bakterija). Mnoge vodene bakterije stvaraju kiseli mukopolisaharid, što im omogućuje da se čvrsto prianjaju za stijene ili druge površine.
