Pod vodstvom svog dinamičnog prvog premijera Barthélemyja Bogande, autonomna republika proglašena je 1. prosinca 1958. Nacija je prethodno bila francuska kolonija Ubangi-Shari (Oubangui-Chari), ali Boganda je preimenovala u Srednjoafričku Republiku i dizajnirao svoju nacionalnu zastavu. U dizajn zastave nisu uvedene nikakve promjene kada je postignuta potpuna neovisnost 13. kolovoza 1960., niti tijekom 1976–79. Godine, kada je vojni vođa Jean-Bédel Bokassa svojom deklaracijom Centralnoafričkog carstva preuzeo carski plašt.
Dizajn zastave Bogande simbolično je izrazio njegovu spoznaju da Francuska i Afrika moraju marširati zajedno. Kombinirao je plavu, bijelu i crvenu francusku trobojnicu s panafričkim crvenim, žutim i zelenim da bi pokazao solidarnost između te dvije civilizacije. U kutu dizala pojavila se žuta zvijezda kao vodič za budući napredak i simbol jedinstva. Plavoj je rečeno da stoji za slobodu, veličinu i nebo, dok je bijela za čistoću, jednakost i iskrenost. Zeleno je predstavljalo šume nacije, žuto je sugeriralo njegove savane, a crveno za zajedničku krv cijelog čovječanstva. Povezanost Europljana i Afrikanaca očitovala se crvenom okomitom prugom koja je prelazila ostale četiri boje.