Yahya Khan, u potpunosti Agha Mohammad Yahya Khan, (rođen 4. veljače 1917., blizu Peshawar, Indija (sada Pakistan) - umro 10. kolovoza 1980, Rawalpindi, Pakistan), predsjednik Pakistana (1969–71), profesionalni vojnik koji je 1966. postao glavni zapovjednik pakistanskih oružanih snaga.
Yahya je rođen u obitelji koja je porijeklom iz elitne klase vojnika Nādera Shaha, perzijskog vladara koji je osvojio 18. Delhi u 18. stoljeću. Školovao se na sveučilištu Punjab, a kasnije je diplomirao najprije u svojoj klasi na Indijskoj vojnoj akademiji u Dehra Dunu. Tijekom Drugog svjetskog rata služio je u Italiji i na Bliskom istoku, a nakon podjele Indije 1947., Organizirao je pakistanski osoblje.
Nakon što je služio u ratu s Indijom zbog regije Kašmir, postao je najmlađi pakistanski brigadni general u dobi od 34 godine, a njegov najmlađi general u 40. Postao je glavni zapovjednik 1966. Pres. Štićenik. Mohammad Ayub Khan, Yahya je zapovjedio vojsku kad su u zemlji izbili ulični nemiri. Ayub ga je pozvao da preuzme smjer vlade i sačuva integritet Pakistana. Imenovan je glavnim upraviteljem borilačkog prava, što je izjavio riječima "Neću tolerirati nered. Neka se svi vrate na svoj post."
Yahya Khan naslijedio je Ayub Khana na mjestu predsjednika kada je potonji dao ostavku na dužnost u ožujku 1969. 1971. godine izbio je ozbiljan sukob između središnje vlade i stranke Awami u tadašnjem Istočnom Pakistanu, na čelu sa šeikom Mujibur Rahmanom. Vođa Istočnog Pakistana tražio je autonomiju za svoju polovicu geografski podijeljene zemlje, a Yahya Khan je odgovorio naredbom da vojska potisne stranku Awami. Brutalnost kojom su izvršavane njegove zapovijedi i posljedični priliv milijuna izbjeglica Istočnog Pakistana u Indiju doveli su do indijske invazije na Istočni Pakistan i rute njegovih zapadnokistanskih okupatora. Istočni Pakistan postao je neovisna zemlja Bangladeš, a svojim je gubitkom Yahya Khan podnio ostavku (20. prosinca 1971.).
Zamijenio ga je ministar vanjskih poslova Zulfikar Ali Bhutto, koji ga je stavio u kućni pritvor. Ubrzo nakon toga paralizirao ga je moždani udar, a nakon puštanja na slobodu nije igrao daljnju važnu političku ulogu.
