Kao dio povjerljivog teritorija Tihih otoka (TTPI), pod upravom Sjedinjenih Država, Palau je bio pod zastavama Ujedinjenih naroda, Sjedinjenih Država i Povjereničke teritorije. Lokalna želja za odvojenom državom i vladom ostvarena je 1. siječnja 1981., a tom prilikom je podignuta zastava Palauana. Natjecanje je održano 1979, što je rezultiralo s više od tisuću prijedloga; jednu odabranu kreaciju stvorio je Blau Skebong, a nova vlada odobrila je 22. listopada 1980. Ova zastava se i danas koristi.
Zlatni disk predstavlja mjesec, koji ima posebno značenje za Palauansku kulturu. Pun mjesec tradicionalno se smatra najboljim vremenom za ribolov, sadnju i druge aktivnosti. Kaže se da daje lokalnom stanovništvu "osjećaj topline, spokoja, mira, ljubavi i kućnog jedinstva." Pozadina zastave nije, kako se može očekivati, simbol Tihog oceana; radije se odnosi na "konačni prolazak stranih tijela vlasti s naše zemlje". Potpunu neovisnost Palau nije postigao sve do listopada 1994., ali tada nije učinjena nikakva izmjena zastave. Izvorna zastava 1981. sačuvana je u muzeju Palau u glavnom gradu Koror. Zastava Palauana po dizajnu je slična zastavi Bangladeša, ali dvije imaju različite boje i simbolike.
