U 1980-im i 90-im, Sikstinska kapela je prošla dugu i razrađenu shemu restauracije koju je sponzorirala japanska televizijska korporacija, a proveli su je vrhunski talijanski i međunarodni stručnjaci. Čišćenje je uklonilo stoljeća prljavštine, prašine i dima svijeća s freski i otkrilo neočekivano sjajne boje koje djelomično proturječe proslavljenim kiparskim osobinama Michelangelovog remek-djela. Žestoka polemika - koja uključuje mnoštvo restautora, povjesničara umjetnosti i stručnjaka za srodna područja - okružila je projekt od njegovog početka. Rasprava je bila usredotočena na jedno veliko pitanje: je li Michelangelo, na način današnjeg slikara freske, modificirao svoju gotovu fresku sekco (suhom) bojom nakon što se žbuka osušila? (Fresko slikari su to obično radili kao način ispravljanja pogrešaka, rafiniranja svojih djela i nanošenja pigmenata koji nisu mogli podnijeti kontakt s vodom.) I ako je to bilo, morali su restaurateri ukloniti svaki sloj do freskirane žbuke krivotvoriti umjetnikove namjere ? U ovom slučaju čini se da su sjene, korekcije i ljepilo koje su restauratori uklonili rezultat posljednih kampanja za obnavljanje. Iako se o raspravi o restauraciji Sikstinske kapele još uvijek ponekad raspravlja, čuvari umjetnosti to više ne smatraju problemom.
