Filipinska neovisna crkva, španjolska Iglesia Filipina Independiente, koja je također nazvana Aglipayan Church, neovisna crkva organizirana 1902. nakon filipinske revolucije 1896–98, u znak protesta protiv španjolskih svećenstva nad kontrolom Rimokatoličke crkve. Suosnivači crkve bili su Isabelo de los Reyes y Florentino, autor, vođa rada i senator, koji je tijekom revolucije bio zatvoren zbog kritike španjolskog svećenstva i vladinih dužnosnika na Filipinima, te Gregorio Aglipay y Labayán, filipinski rimokatolički svećenik koji je 1899. ekskomuniciran zbog svojih aktivnosti u ime revolucije. Aglipay je prihvatio zahtjev de los Reyesa da vrhovni biskup nove crkve postane 1903., na mjestu koje je obavljao do svoje smrti 1940.
Crkva je nastavila slijediti rimokatoličke oblike bogosluženja, ali je dugi niz godina na nauku bio pod jakim utjecajem unitarizma. Razbio se raskol 1946. godine, a crkvu je napustila unitarna frakcija. Pod Isabelo de los Reyes, Jr., izabranom za biskupa 1946., crkva je 1947. usvojila novu izjavu o vjeri i religiozne članke koji su bili trinitarni. Protestantska biskupska crkva u Sjedinjenim Državama 1948. posvetila je tri biskupa filipinske neovisne crkve, a dvije su crkve stupile u blisku suradnju. Godine 1961. crkva je prihvaćena u potpunom zajedništvu s Crkvom Engleske i starokatoličkim crkvama.
Krajem 20. stoljeća članstvo je bilo 1.400.000.
