Čini se da je prva istinska državna zastava na Samoi usvojena 2. listopada 1873. Crvena pozadina nosi bijeli križ koji se proteže do rubova zastave, kao i bijelu zvijezdu u gornjem kutu dizalice. Simbolika je nepoznata, ali križ i zvijezda su možda zagovarali kršćanstvo i neovisnost. Kralj Tamasese, favorizirajući Nijemce koji su posjetili to područje, kasnije je izmijenio nacionalnu zastavu postavivši crni križ na vrh bijelog, dajući njemačkoj crveno-bijelo-crnoj boji Samoi. Ta je zastava bila u upotrebi od 1886. do 1889. godine, ali je prestala koristiti nakon smrti Tamasese. Sjedinjene Države i Njemačka podijelile su otoke 1900. i uspostavile odvojene protektorate na kojima lokalne poticajne zastave nisu poticale.
Početkom 20. stoljeća bivšim njemačkim teritorijom upravljao je Novi Zeland. Razvijena je lokalna zastava za ove otoke koja je odražavala novozelandsku zastavu u njenim crveno-bijelo-plavim bojama, zviježđu Južnog križa i dizajnu polja i kantona. Predstavljena 26. svibnja 1948. nova samoanska zastava bila je crvena s četiri bijele zvijezde na plavom kantonu; 24. veljače 1949. dodana je peta zvijezda. Južni križ bio je popularan grb zastave u drugim zemljama južne hemisfere. Koriste ga, na primjer, Australija, Novi Zeland i Brazil. U samoanskoj zastavi, bijela se kaže da stoji za čistoću, plava za slobodu, a crvena za hrabrost. Nije promijenjena nacionalna zastava kada je zemlja postala neovisna 1. siječnja 1962. godine.
