Prije no što je Kosovo proglasilo neovisnost 17. veljače 2008, nikad nije imalo politički status koji bi mu omogućio vlastitu zastavu. Nakon Drugog svjetskog rata, Kosovo je uključeno u socijalističku Jugoslaviju kao autonomna regija (kasnije autonomna pokrajina) republike Srbije. Savezna vlada odobrila je zastave samo za nekoliko konstitutivnih republika Jugoslavije. Međutim, etničkim Albancima koji žive na Kosovu na kraju je dopušteno da plove albanskom zastavom.
Kosovo je ostalo dio Srbije nakon raspada socijalističke Jugoslavije početkom devedesetih, ali separatistički pokret u pokrajini jačao je tijekom desetljeća. 1998. godine Srbija je poduzela kaznene akcije protiv separatista na Kosovu, kojima je 1999. godine suprostavljala Organizacija Sjevernoatlantskog pakta (NATO). Kosovo je stavljeno pod upravu Ujedinjenih naroda, koja je tamo ostala nakon proglašenja neovisnosti Kosova 2008., dok su ga 2009. godine uvelike zamijenili službenici Europske unije (EU). Srbija i veliki broj drugih zemalja ostali su protiv te izjave o neovisnosti.
Održano je službeno natjecanje za odabir državne zastave za Kosovo. Veliki broj unosa temeljen je na dizajnu albanske zastave, bilo izravno ili neizravno. Izabrani obrazac - pod utjecajem zastave EU - dao je jasnu izjavu naglašavajući Kosovo kao multietničku zemlju. Plava i žuta boja EU zastave korištene su za pozadinu zastave i siluetu nacionalnog teritorija, a krug bijelih zvijezda EU zastave paralelan je s lukom bijelih zvijezda na kosovskoj zastavi. Rečeno je da zvijezde predstavljaju šest glavnih etničkih grupa zemlje (Albanci, Bošnjaci, Gorani, Romi, Srbi i Turci). Međutim, etnički albanski i srpski stanovnici na Kosovu nastavili su koristiti nacionalne zastave.
