Koptska pravoslavna crkva Aleksandrije, koja se naziva i Koptska pravoslavna crkva, Orijentalna pravoslavna crkva i glavna kršćanska crkva u pretežno muslimanskom Egiptu. Egipatski narod prije arapskog osvajanja u 7. stoljeću identificirao je sebe i svoj jezik na grčkom kao Aigyptios (arapski qibṭ, zapadnjački kao kopt). Kad su se egipatski muslimani kasnije prestali nazivati Aigyptioi, pojam je postao prepoznatljivo ime kršćanske manjine. U 19. i 20. stoljeću počeli su se nazivati koptskim pravoslavcima kako bi se razlikovali od Kopta koji su prešli u rimokatoličanstvo (vidi također Koptsku katoličku crkvu) i od istočno pravoslavnih, koji su većinom grčki (vidi također Grčki pravoslavni patrijarhat Aleksandrija).
U 4. i 5. stoljeću nastao je teološki sukob između Kopta i Grka koji govore Grk, ili Melhita, u Egiptu. Koncil Chalcedon (451) odbacio je monofizitsku doktrinu - uvjerenje da je Isus Krist imao samo božansku, a ne ljudsku prirodu, i potvrdio i svoje božanstvo i svoju ljudskost. Melkiti su prepoznali ishod Chalcedona. Koptska crkva, međutim, postala je jedna od nekoliko istočnih crkava koje su odbacile kristološki jezik o dvije Kristove naravi dogovorene u Chalcedonu. Ipak, dok su rimokatoličke i istočno pravoslavne crkve te istočne crkve demantirale kao monofizitske heretike, koptska crkva i druge predhalkedonske ili (od 20. stoljeća) orijentalne pravoslavne crkve zauzele su teološki položaj nazvan miafizitizam. Ispovijedajući izjavu svetog Ćirila Aleksandrijskog (oko 375–444.) Kojom je proglasio „jednu utjelovljenu prirodu Riječi“ Božje, miafiziti su izjavili da su i Kristovo ljudskost i božanstvo podjednako prisutni kroz utjelovljenje u jednoj jedinoj prirodi (otuda Grčki prefiks mia, "isti") kao što je i Riječ učinila tijelom. Umjesto da negiraju Kristovu ljudskost, kao što su za njih optuženi, koptska i druge miafizitske crkve pružile su i njegovoj ljudskosti i božanstvu jednaku prisutnost u Kristovoj osobi.
Nakon arapskog osvajanja Egipta u 7. stoljeću, Kopti su prestali govoriti grčki, a jezična barijera dodala je polemiku. Razni pokušaji kompromisa vizantijskih careva nestali su. Kasnije se arapski kalifi, iako su skloni onima koji su prihvatili islam, nisu miješali mnogo u unutarnje stvari crkve. Džizya, porez koji se obračunava nemuslimanima koji žive u Islamskoj državi, ukinut je u 18. stoljeću.
Arapski se sada koristi u službama Koptske pravoslavne crkve za pouke iz Biblije i za mnoge promjenjive himne; samo određeni kratki refrenima koje ljudi koji prolaze u crkvu svi razumiju nisu na arapskom jeziku. Službene knjige, koristeći liturgije koje su pripisane sv. Marku, sv. Ćirilu Aleksandrijskom i sv. Grgoriju Nazianzu, napisane su na koptskom (aleksandrijski boharski dijalekt), s arapskim tekstom u paralelnim stupcima.
Koptska pravoslavna crkva razvila je demokratski sustav vlasti nakon 1890-ih. Patrijarh i 12 biskupijskih biskupa, uz pomoć vijeća zajednice u kojima su laici dobro zastupljeni, uređuju financije crkava i škola i primjenu pravila koja se odnose na brak, nasljedstvo i druga pitanja o osobnom statusu. Kad patrijarh umre, izborni kolegij, pretežno laici, bira tri odgovarajuće kvalificirana redovnika koja imaju najmanje 50 godina kao kandidate za položaj patrijarha. Između ove tri, konačni izbor se donosi žrijebom nakon molitve.
Biskup najvišeg ranga je aleksandrijski patrijarh koji prebiva u Kairu; zove se papa i od svetog Marka traži apostolsku vlast za svoj ured. Crkva ima svoje osnovne i srednje škole u mnogim mjestima u Egiptu, kao i snažan pokret nedjeljne škole za vjerski odgoj djece koja ne mogu ići u koptske škole. U Kairu postoje Institut koptskih studija, teološki fakultet povezan s institutom i koptski muzej; učenje koptske pravoslavne crkve postalo je čak i nastavni plan i program koji se koristi u vjerskom podučavanju kršćanske djece u vladinim školama.
U Jeruzalemu i drugim područjima Svete zemlje postoje koptske pravoslavne crkve, sagrađene u 19. i 20. stoljeću, kao i koptska biskupija u Kartumu, Sudan. Crkva također ima malu prisutnost u Sjevernoj Americi, Australiji i Velikoj Britaniji. Etiopska, armenska i sirijska pravoslavna crkva sve su orijentalne pravoslavne crkve u zajedništvu s Koptskom pravoslavnom crkvom. Rimokatoličke i istočne pravoslavne crkve stoljećima su se heretičkim smatrale heretičkim. Od kraja 20. stoljeća, međutim, i Koptska pravoslavna crkva, kao i druge orijentalne pravoslavne crkve, započela je dijalog s obojicom, rješavajući mnoge teološke sporove i dobivajući priznanje kao doktrinarno u glavnom toku pravoslavnog kršćanstva.
