Bitka kod Cuzca (svibanj 1536. - ožujak 1537.) Manco Inca, sin Atahuallpe, sa sobom je donio silu od 400 000 ratnika kada je početkom 1536. godine pokrenuo napad na Cuzco. Španski konkvistadori pribjegli su glavnom gradu Inke i pokušali izdržati deset mjeseci. opsade i time učvrstio svoje posjedovanje Perua.
Inka je platila ogromnu zlatnu otkupninu za oslobađanje Atahuallpe - njihovog kralja i boga - nakon njihovog gubitka u bitci kod Cajamarke (1532.), ali vođa konkvistadora, Francisco Pizarro, ipak je svog zarobljenika ipak na kraju zapustio. Manco je zauzeo mjesto vladavine Inka. Isprva se zadovoljio vladanjem marioneta i pobunio se kad je shvatio koliko će malo autoriteta imati. Nalazeći utočište u dolini Yucay, podigao je vojsku: tamo su se slijevali ratnici iz svih krajeva Perua i iz kraljevstva Inka u Ekvador i Čile. Iako su Pizarrove trupe bile pojačane novim dolascima u godinama otkako je zauzeo carstvo Inka sa samo 128 ljudi, Španjolci su i dalje bili nadmoćni.
U svibnju 1536. Inke su bile spremne za osvetu i napadnute. Iznenadili su Španjolce i uspjeli zauzeti veći dio grada. Ono što je presudno, uzeli su nevjerojatnu citadelu Sacsahuamana. Konkvistadori su bili prisiljeni montirati vlastitu protutežu. U međuvremenu, izuzeti od svake podrške, poslali su stranke da potraže pomoć u Novoj Španjolskoj (Meksiko). Ovi izleti su presretnuti, njihovi članovi ubijeni ili zarobljeni. Manco je postavio tim španjolskim zarobljenicima da upute svoje Inke ratnike u upotrebu konja, mačeva i oružja. Međutim, nakon višemjesečne borbe, Španjolci su uspjeli smanjiti zalihe Sacsahuamanu: oni su se potom povukli da napadnu Mancovo sjedište u Ollantaytambo. Ovaj napad je odbijen, ali kako je Manco ušao u Cuzca zbog ubojstva, njegovu snagu je preuzeo iznenađenje. Inke su poražene, a potvrđena je vladavina Španjolca nad Peruom.
Gubici: Nepoznato.
