Konformacija, bilo koji od beskonačnog broja mogućih prostornih rasporeda atoma u molekuli koji su posljedica rotacije njegovih sastavnih skupina atoma oko jednostruke veze.
protein: Konformacija proteina u sučeljima
Kao i mnoge druge tvari s hidrofilnim i hidrofobnim skupinama, topljivi proteini imaju tendenciju migriranja u sučelje zraka
Moguće su različite konformacije za bilo koju molekulu u kojoj jedna kovalentna veza povezuje dvije poliatomske skupine, u kojima svaka barem jedan atom ne leži duž osi dotične pojedinačne veze. Najjednostavnija takva molekula je ona vodikovog peroksida, u kojoj se dvije hidroksilne skupine mogu okretati jedna prema drugoj oko osi veze kisik-kisik. Prisutnost više takovih jednostruke veze u molekuli-kao i da propana (CH 3 CH 2 CH 3), na primjer samo-povećava složenost situacije ne mijenja svoju prirodu. U molekulama kao što su one cijanogena (N―C ≡ C)N) ili butadijna (H ― C―C ― C≡C ― H), svi atomi leže duž osi središnje jednostruke veze, tako da ne postoje razlike koje se mogu razlikovati postojati.
Općenito, svaka prepoznatljiva konformacija molekule predstavlja stanje različite potencijalne energije zbog djelovanja privlačnih ili odbojnih sila koje variraju udaljenostima između različitih dijelova strukture. Ako te sile ne bi bile prisutne, sve bi konformacije imale istu energiju, a rotacija oko jednostruke veze bila bi potpuno slobodna ili neograničena. Ako su snage jake, različite se konformacije jako razlikuju u energiji ili stabilnosti: molekula će obično zauzimati stabilno stanje (jedno s niskom energijom) i podvrći će se prelasku u drugo stabilno stanje samo nakon što apsorbira dovoljno energije da dođe i prođe kroz nestabilno interveniranje konformaciju.
Primjerice, intramolekularne sile etana su toliko slabe da se o njihovom postojanju može zaključiti samo iz suptilnih učinaka na termodinamička svojstva kao što su entalpija i entropija. (Čak i ako su unutarnja rotacija etana bila strogo ograničena, njegove su tri najstabilnije forme nerazdvojne.) Molekularne strukture nekih složenijih spojeva, međutim, nameću tako snažne prepreke rotaciji da su stereoizomerni oblici - različiti samo u konformaciji - dovoljno stabilni da biti izoliran.
