Kromofora, skupina atoma i elektrona koji čine dio organske molekule koja uzrokuje obojenje.
Korelacije između strukturnih značajki kemijskih spojeva i njihove boje traže se od oko 1870. godine, kada je primijećeno da su kinoni i aromatski azo i nitro spojevi često jako obojeni i da se boje smanjuju ili uništavaju kada se spojevi hidrogeniraju. Sposobnost spoja da preuzme vodik, nazvana nezasićenost, uzrokovana je prisutnošću elektrona koji nisu čvrsto fiksirani u kovalentnim vezama između određenih parova atoma, ali zauzimaju veće prostore prostora (molekularne orbitale) koje mogu biti povezane s nekoliko atoma, Ovi elektroni mogu apsorbirati energiju iz svjetlosti preko određenog raspona valnih duljina u vidljivom području; propuštanjem ili refleksijom ostatka svjetlosti nastaje uočena boja spoja. Dolazi do dubokog obojenja ako je nekoliko kromofora usko spojeno u istu molekulu ili je prisutna druga skupina, nazvana auksokrom.
